第十三期/2025年3月 電子萬能試驗機與數位化空間精準定量核酸蛋白分析儀
成大醫院臨床醫學研究中心電子報
第十三期 2025.3.
14年專案型研究計畫 (NanoString DSP) 徵求訊息 
研究服務公告 - 醫療器材研發核心實驗室
主題介紹一 - 電子萬能試驗機
主題介紹二 - 數位化空間精準定量核酸蛋白分析儀(NanoString DSP)
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- 數位化空間基因體與蛋白質體 (NanoString DSP)
•計畫說明：本計畫旨在協助本院同仁運用「數位化空間精準定量核酸蛋白分析儀 NanoString GeoMx DSP (Digital Spatial Profiling)」，探究腫瘤微環境、特異性生物標誌、免疫學與病理學標誌、腫瘤免疫治療或藥物靶向治療、神經疾病生物標誌與機制等研究，提升成大醫學中心醫學研究發展之量能，徵求具前瞻性與創新性之研究計畫
•申請資格及徵求期間：
1.本院專任(院聘)之醫師、醫事人員與醫學研究人員。
2.每人限申請一件專案型計畫。
3.每件補助經費以 80萬元為上限。
4.計畫徵求期間:即日起至114年3月21日下午5:00截止。
•計畫書繳交：將計畫申請書、計畫所需各項同意書(或送審證明)與計畫主持人個人資料表之電子檔(pdf檔)傳送至yc05018@gmail.com，並繳交紙本一份至門診大樓7樓臨醫中心醫學研究人員辦公室(7049室)。
•計畫徵求詳細資訊請參閱臨醫中心網站。
聯絡窗口：臨床醫學研究中心 陳景筠小姐(分機4820)；技術員 蕭雅純小姐(分機 3115)；醫學研究人員 蘇鈺筑博士(分機 6054)。
歡迎有興趣的同仁提出申請
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醫療器材研發核心實驗室
臨床醫學研究中心設有醫療器材研發核心實驗室，提供先進的儀器設備與技術平台，協助研究人員進行骨骼、神經與肌肉相關的研究，促進醫療器材的研發、測試與臨床應用。實驗室主要儀器設備包括電子萬能試驗機與倒立螢光顯微鏡。電子萬能試驗機可進行應力與變形控制，並透過拉伸、壓縮、彎曲及撥離測試，測量材料的彈性係數、降伏點、抗拉強度、拉長率及斷面縮率，適用於測試金屬、非金屬及複合材料等醫藥相關材料，並可應用於關節炎、骨折、肌腱炎、神經傷害與神經再生等動物模型的建立。倒立螢光顯微鏡具備完全電動控制功能，能進行明視野、相位差及螢光觀察等多種影像模式。透過這兩種儀器，實驗室可進行多項測定，協助評估藥物與醫療器材的效果，包括肌肉萎縮、神經功能、骨硬度與力學測試，以及成骨與蝕骨指標蛋白的偵測，歡迎同仁多加利用。
聯絡資訊
技術員：張馨云 (分機3690/5099)
位址：門診大樓6樓06072室
更多詳細資訊請參考臨醫中心核心實驗室網頁 (臨醫中心→核心實驗室→醫療器材研發核心實驗室)
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電子萬能試驗機
電子萬能試驗機（Shimadzu AG-X）是一款高精度、全自動的材料測試設備，廣泛應用於材料力學性能測試。該試驗機具備優異的精度與靈活性，能進行拉伸、壓縮、彎曲、撥離等多種力學測試，並可精確測量材料的彈性係數、降伏點、抗拉強度、拉長率與斷面縮率等關鍵參數。AG-X型號具有高度自動化，透過先進的電子控制系統，能提供穩定且準確的測試結果，並可實現應力與變形控制。
這款設備特別適用於各類金屬、非金屬及複合材料的測試，並廣泛應用於醫療器材、製藥材料及結構材料等領域。其高剛性設計能確保測試過程中儀器的穩定性，即使在高負荷條件下也能保持卓越的測量精度。此外，AG-X試驗機還具備豐富的測試功能和可擴展性，支持各類附件與測量模式，能滿足不同材料與測試需求。
該設備搭載直觀的操作界面和先進的數據分析系統，使用者可以輕鬆設置測試條件並進行實時數據監控與分析，對材料的力學性能進行全面的評估，是科研與產品開發中不可或缺的高端測試儀器。
材料測試應用實例
•肱骨骨折復位固定後的拉伸測試
•二頭肌長頭肌腱的拉伸測試
•遠端肱骨的壓縮測試
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儀器回顧
因目前正徵求 114 年度數位化空間基因體與蛋白質體專案型研究計畫，特別再次與同仁分享第三期電子報中關於 NanoString DSP 儀器的介紹內容，並整理近年來應用 DSP 技術的頂尖論文供同仁參考。
數位化空間精準定量核酸蛋白分析儀 (NanoString Digital Spatial Profiler; DSP)
2019年美國NanoString公司推出數位空間分析技術平台－GeoMx DSP (Digital Spatial Profiling) ，可針對組織上感興趣的區域 (region of interest, ROI) 同時分析20000多個RNA 以及100多個蛋白質的表現情形。此項技術同時解決了PCR、NGS、single cell profiling等分子檢測技術無法呈現組織空間資訊的問題，亦提高了FISH、IHC等組織型態學分析基因或蛋白質的通量，有助於發現參與在疾病發生、演變的生物標記或是訊息傳遞路徑，可應用於癌症、免疫疾病、感染性疾病、神經科學、退化性疾病、組織再生等研究。
以臨床研究為例，病患接受免疫治療前TIS分析 (18-gene tumor inflammation signature)後被判定為熱腫瘤，然而在其組織染色上可見免疫細胞呈現不同的分布型態，可能與不同的治療反應有關，說明運用NanoString DSP加入研究可補足TIS分析上的不足（圖一）。
圖一、大腸癌患者儘管TIS分數都很高，被判別為熱腫瘤，但是組織染色呈現兩種不同的形態：免疫治療效果較差的患者其免疫細胞皆被阻隔在腫瘤細胞之外。
運用NanoString DSP分析檢體的步驟如下：組織染色、拍攝影像、圈選ROI、UV切割、收集寡核苷酸、NGS定序、DSP軟體分析 (圖二)。NanoString公司針對目標RNA或是蛋白質皆有設計相對應的RNA探針或是抗體，並在上面接上一段UV可切割的寡核苷酸。當RNA探針或抗體與組織切片進行雜交反應後，研究人員可利用DSP軟體圈選其感興趣的區域（region of interest, ROI），儀器便透過電子式分光鏡精準地對ROI照射UV光，擷取每個ROI的寡核苷酸，再透過Illumina NGS定序分析，計數每個ROI內RNA或蛋白質的表現量。最後，研究人員可利用DSP軟體快速整合組織上每個ROI內RNA或蛋白質的表現資訊，輸出成Volcano plot、Heat map、KEGG pathway或Correlation plot等數據。這樣的做法既不傷害組織，也可以更真實地呈現RNA或蛋白質在組織上的表現情況，滿足不同研究主題的需求。
圖二、NanoString DSP分析步驟：1. 組織染色； 2. 拍攝影像、圈選ROI；3. UV切割 ；4.5. 收集寡
核苷酸；6. 重複步驟3-5以繼續收集其他ROI；7. NGS定序及DSP軟體分析。
藉由這項全新的空間組學分析技術，研究人員得以在特定區域進行多重基因檢測，目前已有許多團隊的研究成果成功發表於國際期刊。根據Web of Science的數據，2023至2024年間，使用NanoString DSP技術的研究團隊已經發表了37篇文章，其中更有7篇影響因子大於10的論文，研究領域涵蓋腫瘤微環境、病毒感染、神經科學、退化性疾病等。此外，也有研究團隊發表針對DSP資料的分析方法，這些成果顯示DSP技術成為研究人員的強大工具，能夠顯著提升研究效率和深度。
IF>10國際期刊論文分享：
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【論文獎勵公告】依據113年10月17日成附醫臨醫字第1131500015號函公告，自2025年1月1日起調整部分期刊論文獎勵發放金額如下：(1) 第一類期刊(MDPI、Frontiers Media、Baishideng Publishing Group、OMICS Publishing Group)分為兩階段：2025年1月1日起投稿之論文，獎勵金*30%；2025年7月1日起投稿之論文則停發獎勵金；(2) 2025年1月1日起投稿在「類別二加強實質審查期刊名單」則由獎金*50%修訂為獎勵金*30%，並將BMC系列期刊列入此類。
【院內計畫公告】依據114年1月9日成附醫臨醫字第1141500002號函公告，113年院內計畫主持人應於114年3月31日前將研究計畫結案報告上傳至院內研究計畫線上申請系統（http://120.114.241.101:8080/rpms/bll/bll2.jsp）。未依規定時間內繳交報告者，停止其申請下年度院內研究計畫之資格。
【演講公告】114/3/21(五)12:30-14:00，邀請台北醫學大學吳麥斯校長演講，講題為Streamlined Clinical Trials: Trends and Key Success，演講地點為醫學院1樓第一講堂。
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近期儀器訓練課程:
生醫光學影像核心平台網頁報名 (https://bioimage.med.ncku.edu.tw/index.php?modify=course)
3月 7日 倒立與水平對射式雙收光片層光顯微鏡(Light sheet)儀器說明課程
3月 7日 HIVE高速科研數據處理系統
3月28日 NIS長時間活細胞影像系統
臨醫中心網頁報名 (https://crc.hosp.ncku.edu.tw/index.php?modify=course)
3月12日 海馬生物能量測定儀(Seahorse XFe-24)
3月19日 Backman Avanti-J26XP高速離心機、Beckman Optima L-90K超高速離心機及桌上
型離心機
3月21日 全景組織體細胞定量分析儀(TissueFaxs)
3月26日 Ingenuity Pathway Analysis (IPA)的應用
3月28日 NIS長時間活細胞影像系統
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分享近期同仁發表之優秀論文，請參閱臨醫中心論文發表榮譽榜
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【院外計畫】國科會徵求114年度醫藥與醫材領域「應用型研究育苗專案計畫」，申請日期自即日起至民國114年3月20日(四)上午10:00完成線上申請。
【院外計畫】財團法人國家衛生研究院徵求115年度整合性醫藥衛生科技研究計畫，申請日期自即日起至民國114年3月31日(一)下午4時前完成線上申請。
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敬請同仁於使用臨醫中心資源並發表論文時，於論文致謝欄（Acknowledgement）加註致謝臨醫中心並通知儀器管理員。致謝文句請參考以下範例：We thank the staff of Clinical Medicine Research Center, National Cheng Kung University Hospital for the technical support.